Fundusz od początku wspierał zapobieganie oraz likwidację poważnych awarii i ich skutków poprzez dofinansowanie systemu ratownictwa chemiczno-ekologicznego w ramach Krajowego Systemu Ratowniczo-Gaśniczego, a także rozwoju bazy jednostek Ochotniczej Straży Pożarnej. Przy udziale środków Funduszu realizowano budowę zbiorników wodnych oraz naprawę i odbudowę wałów przeciwpowodziowych. Ponadto Fundusz dofinansowywał doposażenie gmin w środki techniczne, umożliwiające skuteczne działanie na wypadek klęski żywiołowej, wspomagał doskonalenie regionalnego monitoringu środowiska w ramach systemu Państwowego Monitoringu Środowiska oraz opracowanie programów ochrony powietrza.